三清山的海拔为1819.9米。 三清山主体南北长12.2公里，东西宽6.3公里，平面呈荷叶形，由东南向西北倾斜。位于欧亚板块东南部的扬子古板块与华夏古板块结合带的怀玉山构造快体单元内。地处怀玉山脉腹地，属花岗岩构造侵蚀为主的中山地形。山势是东、南、西三面陡峻，北面稍缓。
三清山的海拔为1819.9米。
三清山主体南北长12.2公里，东西宽6.3公里，平面呈荷叶形，由东南向西北倾斜。位于欧亚板块东南部的扬子古板块与华夏古板块结合带的怀玉山构造快体单元内。地处怀玉山脉腹地，属花岗岩构造侵蚀为主的中山地形。山势是东、南、西三面陡峻，北面稍缓。
三清山的山势是东、南、西三面陡峻，北面平缓，地势高差很大。从整体看，东坡从金沙至玉京峰，西坡从横坦、汾水至玉京峰，恰为两个相靠的凹球面，它们与南部的凸球面合成高耸入云、层峦叠峰的奇特地貌。
东坡比西坡平缓，南坡又比东坡平缓，组成三清山主体的岩石为燕山晚期花岗岩，其中边缘相和过渡相的花岗岩是构成三清山峰峦的主要岩石，近谷底则多为内部相的中粗粒斑状、似斑状黑云母花岗岩，因其极易风化剥蚀，故多形成稍缓地形。
三清山的主要山峰：
天门峰位于玉京峰西北，与灵龟峰对峙，两峰中间是少华福地三清宫的要隘天门。峰居三清宫北，海拔1568米，石壁上刻有“天梯”两个大字。峰顶是一巨大花岗岩岩体，光洁平坦，面积有数百平方米。
灵龟峰位于天门峰东面，海拔1557.8米，峰上一岩状如灵龟而伏。东北飞崖断壁怪石嶙嶙，西南平缓，绿树成荫。峰顶有潘公庙，庙座岩石上镌有“灵龟峰”三个大字。
五门峰与冲虚峰隔涧相望，南北对峙。巉岩迭立，险隘关口，古人在关口岩壁上分别刻有“东天门”、“南天门”、“西天门”、“北天门”、“中天门”等楷书大字，故称五门峰。东北岩壁上有琵琶石、母子石。母子石下有众妙千步门，是通往三清宫的第二要隘。穿过千步门，千步岭沿峰直上，全长500余级石阶。